Jaime Alcorta

PhD. Student

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El estudio de los genomas microbianos ha revelado aspectos fundamentales sobre la evolución de la vida. Las nuevas metodologías de secuenciación de DNA han permitido mayor análisis de estos genomas desde muestras ambientales sin necesidad de aislarlos, y nuestra búsqueda en este momento se enfoca en el estudio de los miembros de los tapetes microbianos que se desarrollan en fuentes hidrotermales a lo largo de todo el mundo. Nuestra línea de investigación abarca dos ejes centrales:

  1. El estudio de los genes relacionados a varios ciclos biogeoquímicos (carbono, nitrógeno, azufre, entre otros) en metagenomas de termas de todo el mundo y los genomas ensamblados desde metagenomas (MAGs por sus siglas en inglés) de los miembros que podrían estar involucrados en ellos, a partir de más de 80 metagenomas desde 32 a 98 °C.

  2. El estudio de la genómica comparativa de las cianobacterias, que corresponden a un grupo importante en el ambiente termal (y de importancia global en muchos ecosistemas como el océano), para la búsqueda genes que pudieran estar relacionados con la adaptación a las altas temperaturas, junto a un enfoque en la evolución del género Fischerella donde encontramos cianobacterias filamentosas, ramificadas y formadoras de heterocistos.

    Estos genomas nos ayudarán a comprender el funcionamiento y la composición de las comunidades microbianas en sistemas extremos, y ayudarán a entender cómo los genes relacionados con los ciclos biogeoquímicos o las adaptaciones a las altas temperaturas se han diseminado a lo largo del árbol de la vida.

Interests

  • Cyanobacteria
  • Hot Springs
  • Metagenomes
  • Comparative Genomics
  • Microbial Taxonomy



Education

MSc. Bioquímica, 2018

Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile

Bioquímica, 2015

Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile




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alcorta.jaime@gmail.com
       
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