Natali Zamora Bugueño

PhD. Student

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Mi quehacer dentro del laboratorio es que, a través de mi tesis doctoral, se logre determinar y evaluar los efectos del cambio climático sobre la diversidad taxonómica y funcional de las comunidades procariotas presentes en suelos desérticos de todo el mundo a lo largo de una gradiente de temperatura y de aridez. La idea del estudio de las gradientes es emular los posibles escenarios en que se encontraran nuestros suelos en unos años más, debido a los drásticos cambios del clima y la temperatura. Es por esto, que mi investigación ayudará a predecir cómo será el efecto de la temperatura en los próximos años producto del calentamiento global en las comunidades y su función en los ciclos biogeoquímicos de suelos desérticos ya previamente afectados por la aridez y nos permitirá identificar biomarcadores que pudiesen ayudar a predecir cambios la aridez de un suelo producto del cambio climático.
Este estudio se lleva a cabo a partir del análisis de metagenomas extraídos desde las bases de datos públicos de estudios de composición de la estructura microbiana de suelos de desiertos con disponibilidad de la metadata de las condiciones ambientales y climáticas, que serán ordenados en una escala de aridez y una gradiente de temperatura, a los cuales se realizará asignación taxonómica por herramientas bioinformáticas y diferentes análisis de índices de diversidad α y β, mediante el uso de software estadísticos como Rstudio. Además, dentro de mi investigación, realizará el estudio de la diversidad funcional mediante ensambles y co-ensamblajes de metagenomas y adicionalmente, con la ayuda de software bioinformáticos, se realizarán análisis de ensamble de genomas desde los metagenomas (MAGs) de los grupos microbianos más representativos. Por otra parte, para analizar y comparar los diferentes ciclos metabólicos de cada uno de los desiertos y se analizará también el tamaño del genoma y porcentaje de GC dentro del genoma dentro de los organismos procariontes, se determinará la relación bacteria – arquea, y se analizarán las enzimas activas de carbohidratos (“CAZymes”) presentes en condiciones extremas, a partir de la anotación de las secuencias CDS a través del uso de la herramienta dbCAN2.
Finalmente, con el fin de determinar los efectos de la temperatura y la desecación a corto y largo plazo sobre las comunidades de bacterias y arqueas presentes en suelos, se montarán experimentos de microcosmos para analizar diversidad funcional y taxonómica a partir de las técnicas mencionadas anteriormente. Desde el desierto de Atacama (Chile) se extraerán muestras suelos con diferentes niveles de aridez. Dichas muestras serán sometidas a diferentes temperaturas bajo estrés hídrico, para simular eventos de desecación, en un rango de tiempo de dos semanas.

Interests

  • Microbial Ecology.
  • Extremophilic bacteria.
  • Bacterial communities of desert soils.
  • Data Sciences.
  • Statistics Software.

Education

MSc.(C) Estadística, 2021

Universidad de Valparaíso, Chile

Bioquímica, 2016

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile



Contact

natali.zamora@gmail.com
   

Natali Zamora Bugueño
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