Equipo

Sebastián Fuentes

Postdoctoral Position

Sebastián investiga la estabilidad de comunidades microbianas de suelos antárticos frente a contaminación con hidrocarburos.

¿Por qué?

Porque los microorganismos son actores principales en los ciclos biogeoquímicos. Juegan un rol fundamental en el reciclaje de nutrientes, descomposición de materia orgánica y degradación de compuestos orgánicos persistentes. Las perturbaciones ambientales, sean naturales o antropogénicas, alteran las comunidades microbianas, pudiendo afectar su estabilidad y funciones ecológicas. Por su parte, los suelos antárticos son sistemas relativamente simples, donde la cadena trófica es principalmente microbiana. Estos suelos se encuentran bajo un creciente riesgo ambiental, principalmente en zonas pobladas y debido al uso de combustibles fósiles.

¿Cómo?

Sebastián estudia cómo la historia de una comunidad (histéresis) influye en el grado en que las comunidades soportan la perturbación (resistencia) y se recuperan de la misma (resiliencia). Mediante experimentos de microcosmos in situ y ex situ contaminados con diésel, evalúa la estabilidad y dinámica de componentes ecológicos (e.g. diversidad, estructura) y fisiológicos (e.g. respiración, expresión génica) de las comunidades microbianas. Para ello, emplea técnicas como secuenciación masiva del gen rRNA 16S, metagenómica, metatranscriptómica, qPCR de genes funcionales (e.g. degradación de hidrocarburos, ciclos biogeoquímicos), viabilidad celular, GC-MS, entre otras.

E-Mail: sebastian.fuentes.a@gmail.com

CV Sebastián Fuentes

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María Estrella Alcamán

Postdoctoral Position. Mención Genética Molecular y Microbiología

María Estrella desarrolló su tesis doctoral en el marco de la línea de investigación de diazotrofía en sistemas termales. Los aspectos claves de su investigación están relacionados con dilucidar quiénes y cuál es la importancia de los principales microorganismos diazótrofos, principalmente cianobacterias que conforman el tapete microbiano a lo largo de gradientes de temperatura en sistemas termales de Chile. A través de la biogeoquímica estudia la incorporación isotópica de C y N en sistemas termales, y con métodos moleculares (DGGE, librería de clones, qPCR) y bioinformáticos (metagenómica-metatranscriptómica) busca describir sus patrónes de actividad diarias de asimilación y fijación de nitrógeno (¹⁵N₂ ¹⁵NH₄Cl, K¹⁵NO₃) y carbono (H¹³CO₃). Conocer las estrategias de asimilación de N y C de las principales poblaciones activas de organismos diazótrofos y autotrofos, le ha permitido definir la relevancia de éstos organismos en cuanto a su contribución en estos sistemas naturales extremos. En el laboratorio trabaja usando como modelo de estudio aislados de cianobacterias termófilas  del sistema termal de Porcelana (Patagonia Norte), los cuales esta caracterizando para entender su actividad respecto a la asimilación de N y C a altas temperaturas.

Actualmente se desempeña como postdoc en la línea polar del grupo.

E-Mail:mealcaman@uc.cl

CV María Estrella Alcamán

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Sergio Gajardo-Leiva

Estudiante de Doctorado (PhD). Mención Genética Molecular y Microbiología

Sergio está trabajando en describir las comunidades virales que infectan tapetes microbianos fotoautotróficos en sistemas termales, con especial énfasis en los bacteriófagos que infectan a los phila Cianobacteria y Cloroflexi. Esta evaluando el impacto de bacteriófagos en la diversidad, evolución y ecología de estos microorganismos termófilos utilizando técnicas de secuenciación masiva de ADN y ARN en muestras naturales y aislados en cultivo.

E-Mail:seguajardo@uc.cl

CV Sergio Guajardo

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Pablo Vergara Barros